2个校区。临沂校区和济南校区。
临沂校区：山东省临沂市兰山区聚才六路，邮编：276000
济南校区：山东省济南市市中区二环南路5460号，邮编：250002
山东医学高等专科学校设临沂、济南两校区，临沂校区为1966年青岛医学院在沂水设立的分院，1972年更名为沂水医学专科学校，1982年开始迁址临沂，1986年更名为临沂医学专科学校，2004年更名为山东医学高等专科学校。济南校区前身为1954年建立的山东省卫生干部学校，1958年更名为山东省卫生干部进修学院、山东省济南卫生学校，1989年复建山东省卫生学校，2005年并入山东医学高等专科学校。
学校设有17个教学系部，开设30个专业。其中中央财政支持重点建设专业2个、全国首批职业院校健康服务类示范专业1个、教育部现代学徒制试点专业1个、教育部1+X证书制度试点项目9个、高等职业教育创新发展行动计划重点建设专业1个、省级特色专业7个、省级高水平专业群2个、省级品牌专业群专业3个、“3+2”专本对口贯通分段培养专业2个、省属公费医学生培养专业2个、中外合作招生专业3个。学校是山东省医药卫生与健康服务类规模最大、专业设置最全的省属公办全日制普通高等专科学校。
