全国医科大学排名靠前的有：北京协和医学院、首都医科大学、南京医科大学、天津医科大学、南方医科大学、哈尔滨医科大学、中国医科大学、重庆医科大学、温州医科大学、以及广州医科大学等。
全国医科大学排名50强
| 序号 | 学校名称 | 办学层次 |
| 1 | 北京协和医学院 | 世界知名高水平大学 |
| 2 | 首都医科大学 | 中国一流大学 |
| 3 | 中国药科大学 | 中国一流大学 |
| 4 | 北京中医药大学 | 世界高水平大学 |
| 5 | 哈尔滨医科大学 | 中国一流大学 |
| 6 | 天津医科大学 | 中国高水平大学 |
| 7 | 南方医科大学 | 中国高水平大学 |
| 8 | 南京医科大学 | 中国高水平大学 |
| 9 | 中国医科大学 | 中国高水平大学 |
| 10 | 上海中医药大学 | 世界高水平大学 |
| 11 | 重庆医科大学 | 中国高水平大学 |
| 12 | 天津中医药大学 | 中国一流大学 |
| 13 | 河北医科大学 | 中国高水平大学 |
| 14 | 南京中医药大学 | 中国一流大学 |
| 15 | 广州医科大学 | 中国高水平大学 |
| 16 | 广州中医药大学 | 中国一流大学 |
| 17 | 山西医科大学 | 中国高水平大学 |
| 18 | 温州医科大学 | 中国高水平大学 |
| 19 | 安徽医科大学 | 区域一流大学 |
| 20 | 山东第一医科大学 | 中国高水平大学 |
| 21 | 新疆医科大学 | 区域一流大学 |
| 22 | 大连医科大学 | 区域一流大学 |
| 23 | 黑龙江中医药大学 | 中国高水平大学 |
| 24 | 广西医科大学 | 区域一流大学 |
| 25 | 河南中医药大学 | 区域一流大学 |
| 26 | 昆明医科大学 | 区域一流大学 |
| 27 | 宁夏医科大学 | 区域高水平大学 |
| 28 | 山东中医药大学 | 区域一流大学 |
| 29 | 湖北医药学院 | 区域一流大学 |
| 30 | 福建医科大学 | 区域一流大学 |
| 31 | 沈阳药科大学 | 中国高水平大学 |
| 32 | 成都中医药大学 | 中国高水平大学 |
| 33 | 福建中医药大学 | 区域一流大学 |
| 34 | 长春中医药大学 | 区域一流大学 |
| 35 | 广西中医药大学 | 区域一流大学 |
| 36 | 贵州医科大学 | 区域高水平大学 |
| 37 | 浙江中医药大学 | 区域一流大学 |
| 38 | 辽宁中医药大学 | 区域一流大学 |
| 39 | 徐州医科大学 | 区域高水平大学 |
| 40 | 安徽中医药大学 | 区域一流大学 |
| 41 | 锦州医科大学 | 区域高水平大学 |
| 42 | 海南医学院 | 区域高水平大学 |
| 43 | 内蒙古医科大学 | 区域高水平大学 |
| 44 | 遵义医科大学 | 区域高水平大学 |
| 45 | 江西中医药大学 | 区域一流大学 |
| 46 | 贵州中医药大学 | 区域一流大学 |
| 47 | 潍坊医学院 | 区域高水平大学 |
| 48 | 皖南医学院 | 区域高水平大学 |
| 49 | 新乡医学院 | 区域高水平大学 |
| 50 | 蚌埠医学院 | 区域高水平大学 |
全国最好的医科大学有哪些
1. 北京协和医学院
北京协和医学成立于1917年，是我国最高医学研究机构和最高医学教育机构。北协和开创了我国八年制医学教育、高等护理教育等制度。
目前拥有“双一流”建设学科5个，并在教育部第四轮学科评估中，获评6个A类学科，并拥有国家级重点实验室6个;此外，学校直属6所医院，形成了国内外闻名的医疗、教学和科研紧密结合的医疗服务体系。
2. 首都医科大学
学校建校于1960年，拥有22所临床医学院。在学科建设上，现有8个8个国家重点学科，2个国家重点(培育)学科。学校有12个学科进入ESI学科全球前1%排名，包含临床医学、神经科学与行为学等。学校的临床医学、药理学与毒理学进入ESI学科前1‰，还有4个学科进入前5‰。
